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Datensicherung und Dateiformate

Datenformate

Alle NMR- Daten werden den Nutzern der NMR-Abteilung als Rohdaten zur Verfügung gestellt. Um die Kosten der Serviceabteilung auf die Arbeitsgruppen umlegen zu können werden die Daten über den Dateinamen dem jeweiligen Mitarbeiter zugerordnet. Die Abrechnung erfolgt dann gemäss der beanspruchrten Messzeit automatisch. Die Dateinamen bestehen aus dem Namemn des Auftraggebers, eine Zahl, einem Kürzel zur Kennzeichnunng des jeweiligen Experiments. Für Daten die vom Spektrometer Ac250 stammen können wir anstelle des Namens nur einen Satz von Innitialen verwenden. Abhängig von dem Dateiformat kann noch eine Experimentnummer zur Kenzeichnung der Messung verwendet werden. Zur Prozessierung der Daten stehen den Mitarbeitern die Programme TOPSPIN (4 Float- Lizenezen) der Firma Bruker und das Programm Delta(frei verfügbar, download bei jeol.com) der Firma JEOL zur Verfügung. Entsprechend werden die Rohdaten von allen Spektrometern in die Formnate beider Hersteller konvertiert:

JEOL- Delta- Format: Eine Datei pro Spektrum (z.B. nutzername1_1h-1.jdf, nutzername3_cosy-1.jdf oder nm_1h-1..10.jdf(AC250)

Bruker Topspin-/XWINNMR- Format: Ein Verzeichnis (z.B. nutzername1_1h/1/fid ../pdata/1/.. evntl meherer Experimentnummern nutzername1_1h/1,2,3/fid ../pdata/1/..

Die NMR- Daten von allen Spektrometern werden auf einen zentralen NMR- Server tranferriert (decan.chemie.fu-berlin.de), von wo sie über das Institutsnetz abgerufen werden können. Sie finden sich dort in einem dem jeweiligen Spektrometer und benötigtem Format zugeordneten Verzeichnissen.Für die Benutzer älterer Programme, welche digital gefilterte Daten noch nicht verarbeiten können (Winnnmr, MetreC), wurde noch ein Verzeichniss angelegt, in welchem die Daten bezüglich auf eine digitale Filterung korrigiert wurden:

/a/data/ac250/delta AC250, Delta- Format

/a/data/ac250/nmr AC250, ECP500, Topspin, Xwinnmr - Format

/a/data/dpx400/delta DPX400, Delta- Format

/a/data/dpx400/nmr DPX400, Topspin, Xwinnmr - Format

/a/data/dpx_XW/nmr AV700, Xwinnmr - Format

/a/data/ecx/delta ECX400, Delta- Format

/a/data/ecx/nmr ECX400, Topspin, Xwinnmr - Format

/a/data/ecp/delta ECP500, Delta- Format

/a/data/ecp/nmr ECP500, Topspin, Xwinnmr - Format

/a/data/av/delta AV500, Delta- Format

/a/data/av/nmr AV500, Topspin- Format

/a/data/av_XW/nmr AV500, Xwinnmr - Format

/a/data/700/delta AV700, Delta- Format

/a/data/700/nmr AV700, Topspin- Format

/a/data/700_XW/nmr AV700, Xwinnmr - Format

Die auf dem AC250 gemssen FIDs können auch direkt von dem Server nmr.chemie.fu-berlin.de (Bruker X32) heruntergeladen werden. Für alle Nutzeri, die ihre auf dem AC250 gemessenen FIDs mit der Jeol Delta Software prozessieren möchten, ist die Partition /a/data/ac250/delta gedacht.

Den Koperationspartnern audserhalb der FU werden die Messdaten als JCAMP(ascii) oder Delta- Dateien per email zugesandt.

Datensicherung

Alle Roh- Daten werden für 10 Jahre auf den Servern der Zentaleinrichtung für Datenvrearbeitung der FU- Berlin gesichert

ZEDAT(Backup Service)

 

Neuigkeiten

Nutzung des AVANCE700

online Queue ECP500

online Queue ECX400

 

Formulare

NMR Spektrenformular doc

NMR Spektrenformular pdf

CHN-Auftragsformular doc

CHN-Auftragsformular html

Informationen zur Abgabe von NMR- Proben

Angaben zu den Geräten

 

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